质量管理：管理GSP所需要的各种审批管理、记录管理、报表管理、台帐管理、档案管理等。 门店的处方登记记录 管理。所有涉及物流的各种记录自动生成。
采购管理：负责采购计划的制定，商品采购。包括采购业务员管理、供应商帐龄帐期管理、 供应商信用额度管理、最高（后）进价管理等 验收入库管理：入库验收管理（正常验收、退回验收）、入库管理、入库差价管理、入库退货管理。 自动生成“购进记录”“入库验收记录”“拒收记录”等。
发票管理：进行发票与入库明细的核销，避免出现发票未到就付款的情况。
付款管理：付款计划的制定，付款与发票明细、入库明细的核销，准确品种级管理应付帐款。
物价管理：负责新商品的市场定价、老商品采购价格变动后售价的变动。其他市场策略的市场价格变动。 价签的打印、价格变动后的市场效果分析等。
促销管理：负责商品促销方案的制定，买赠的确定，限量的确定等。促销的分析。
库存管理：企业一般会有前台库存、后台库存之分，前后台之间的管理需要区分商品保管的责任， 会有“仓库调拨”的管理。盘点管理（商品盘点、批次盘点）等。
会员管理：会员的录入、会员的政策确定、分析等 前台收款管理：前台收款管理、退回管理、限价管理，日清日结等。可能会有柜台与超市并存的业务模式 （超市拿商品到款台交款，柜台情况顾客拿小票到柜台交款）。
营业员管理：营业员的提成管理、区域业绩管理等 核算管理：财务每天每月的成本核算管理、月（年）结账处理、本期销售成本修正处理、上期成本调整处理、 凭证设置生成管理等。可销价核算、进价核算并存。
中药划价：中药处方的划价、反畏检查、医师提成等。企业可以实现“划价与收款”分离的业务模式。
其他管理：厂家租赁柜台的管理、返点结算的管理、按柜组核算的管理等；损溢类单据处理、调价单处理、 仓库调拨单处理等。
异常管理：把所有“异常”按工作人员权限设置负责人，例如近效期提醒、价格高低提醒等等。
财务管理：帐务、银行、现金、往来、费用、现金流量、报表等 统计分析：各种统计分析可企业自定。